Những Chú Chim Cánh Cụt Đến Từ Madagascar trông có vẻ đáng yêu nhưng thực chất lại vô số tội, những chú chim cánh cụt Skipper, Kowalski, Rico và Private không chịu an phận với cuộc sống tại vườn thú trung tâm nên đã bày cách thoát ra ngoài qua hệ thống tàu điện và ống cống ngầm của New York.

Tạm xa rời những người hàng xóm dễ thương, bộ tứ lao vào cuộc phiêu lưu mới. Series phim xoay quanh những kế hoạch tài ba và hài hước của bốn chú chim cánh cụt. Liệu vườn thú New York có giữ được sự yên bình khi bốn chú chim cánh cụt nghịch ngợm đang ngấm ngầm thực hiện những phi vụ bí mật? Vị trí độc tôn “tự phong” liệu còn tồn tại?