Phim Madagascar 2: Tẩu thoát đến Phi Châu trong tập trước Cuộc Phiêu Lưu Tới Madagascar, sử tử Alex, ngựa vằn Marty, hươu cao cổ Melman, và nàng hà mã Gloria bị số phận đưa đẩy đến với xứ đảo Madagascar. Bị bỏ rơi trên hòn đảo xa xôi này, bộ tứ đối diện với muôn vàn khó khăn.

Nhưng với sự giúp đỡ của vượn cáo Julien, Maurice, và nhóm chim cánh cụt tinh nhuệ, những cư dân của New York ấy ấp ủ kế hoạch trở về quê hương hết sức điên rồ. 3 gã cánh cụt đã sửa chữa một chiếc máy bay gặp tai nạn trên đảo, cho khai trương hãng hàng không Chim Cánh Cụt và những hành khách đầu tiên không ai khác chính là Alex và những người bạn.