Lớp Học Ám Sát: 365 Ngày Trái đất đang đối mặt với mối nguy là một sinh vật có hình dáng giống bạch tuộc có sức mạnh siêu phàm đã phá hủy 70% mặt trăng, biến mặt trăng thành hình trăng khuyết mãi mãi. Sinh vật đấy tuyên bố rằng sau một năm, Trái Đất cũng sẽ bị hắn phá hủy, nhưng hắn đã cho nhân loại một cơ hội để thay đổi số phận. Hắn đề nghị được làm thầy giáo của lớp kém nhất trường trung học Kunugigaoka, lớp 3-E, và sẽ dạy các học sinh ấy không chỉ các môn học bình thường mà còn dạy nghệ thuật ám sát. Chính phủ Nhật Bản đồng ý và đã treo mức giá 10 tỷ yên cho học sinh nào giết được sinh vật này và “Lớp học ám sát” được bắt đầu.